Um Elektroenergie in den Grundwasserleiter einzutragen, werden Elektroden in wassergefüllte Brunnen eingebracht und an eine Gleichstromquelle angeschlossen. Das sich ausbildende elektrische Feld bewirkt einen Transport des Grundwassers und der darin gelösten Schadstoffe, wobei positiv geladene Moleküle und Ionen zur Kathode wandern und negativ geladene Ionen oder Moleküle sich zur Anode hin bewegen. Die zugrunde liegenden physikalischen Prozesse sind zum einen die Elektroosmose, welche den Transport organischer Schadstoffmoleküle (z. B. Mineralöle, Phenole) bewirkt, zum anderen die Elektromigration welche den Transport geladener Schadstoffe wie z. B. Schwermetalle bewirkt. Das im Elektroden-Brunnen anfallende, mit Schadstoffen belastete Wasser wird über Pumpen entnommen und einer Abwasserreinigung zugeführt.